生物工程学院前身为河北轻工业学院发酵工程专业，建于1958年。1964年北京轻工业学院发酵工程专业迁入我院，成为我国高校中实力最强的两个发酵工程专业之一。1993年改名为生物化工专业，1998年根据国家教育部颁布的高等学校本科专业目录又更名为生物工程专业。2020年与瑞普、康希诺、华熙、天津药研院、丹娜等行业头部企业共建了生物医药现代产业学院。2021年启动建设了天科大-中科院工程生物学院。其中生物工程专业为国家级一流本科专业、国家特色专业、教育部卓越工程师培养计划入选专业、天津市品牌专业、天津市优势特色专业，工程教育认证通过专业；制药工程专业为国家级一流本科专业、天津市战略性新兴产业相关专业、天津市应用型专业。

学院现有教职工143人。其中专任教师105人，具有高级职称教师71人，具有博士学历教师占比100%。有国家教学名师1人、国家“万人计划”入选者3名、国家“百千万人才工程”1人、国家有突出贡献中青年专家1人、国家青年拔尖1人、国务院政府特贴专家3人、外籍院士1人，有校聘教授20人。建设有国家级教学团队1支、天津市教学团队3支；教育部“长江学者奖励计划”创新团队1支、天津市“131”创新型人才团队2支、天津市重点领域创新团队1支。目前在校博士、硕士研究生1100余人，本科生900余人。

学院拥有轻工技术与工程一级学科博士点和博士后流动站，下设发酵工程、发酵食品与健康2个二级学科博士点，拥有生物工程、药学2个一级学科硕士点，同时拥有生物与医药专业学位博士和硕士点及在职工程硕士学位点。其中“发酵工程”学科为国家重点学科，轻工技术与工程学科为天津市一流学科、药学学科为天津市重点学科。近年来，学院科研项目不断攀升，累计承担和完成了国家、省部级和横向科研项目500余项，其中主持2项国家重点研发计划项目，7项国家重点研发计划课题，80余项国家自然科学基金项目，千万元级别重大横向合同2项，500万以上横向技术开发合同4项，多项成果达到国际领先、国际先进水平，使企业取得了重大经济和社会效益；科研成果不断取得新突破，荣获国家科技进步二等奖、中国专利优秀奖、天津市科技进步一等奖等国家级和省部级科技奖30余项，中国轻工业联合会、中国商业联合会等社会科技奖30余项。五年来在国内外学术刊物上发表学术论文1200余篇，其中SCI学术论文550余篇，授权国家发明专利近300件。

几十年来，学院培养的一大批毕业生已成为行业领军人物、企事业单位领导及相关领域知名专家，在生物工程、制药工程等行业发挥重要作用，获得社会普遍赞誉。

学院先后与日本、英国、法国、美国、德国、捷克等国进行了多项合作人才培养、科研和学术交流，建设有中英合作办学项目、中英双硕士项目、留学生全英文本科项目、中英联合酿酒实验室等，打造了“对内与对外”双向合作的国际化教育、科研与交流合作体系，同时也为全体师生提供了国际化交流平台，拓展了国际视野。